不同点
城轨覆盖3个城市，城铁覆盖全省大部分城市 原来计划的长株潭城际轨道交通仅覆盖长沙、株洲、湘潭3大城市，就地域范围而言，毕竟占全省的一小部分。而新建长株潭城际铁路除覆盖长沙、株洲、湘潭外，还对接岳阳、常德、益阳、衡阳、娄底5大城市，几乎把我省的大部分中心城市都覆盖了。
城轨时速120公里，城铁可开到200公里 城际轨道交通上的列车尽管比地铁快（地铁时速最多不能超过80公里，城际轨道交通的时速可以开足120公里），但它行驶的速度仅仅跟高速公路上飞驰的小车相当。而城际铁路全部使用动车组，时速可以开到200公里以上，相当于城际轨道交通上列车速度的2倍，且像大巴一样不断发车，乘客坐城际列车就像坐大巴一样。
城轨3-5公里一个站，城铁8-10公里才一个站例如长株潭城际轨道交通仅满足任意两个城市之间市民的交通需求，一般来说设站较密，大约每3-5公里必须有一个站。而长株潭城际铁路因车速太快，站点不宜设置得太密，可能每8-10公里才会有一个站。当然具体多远设站，还要根据具体人居情况，由专家考察后确定。
城轨由地方政府委托管理，城铁由铁道部管理 城际轨道交通由省政府投资，建成后由地方政府委托管理，而城际铁路由铁道部和省政府共同投资，建成后纳入全国铁路大网络，由铁道部统一管理。据悉，新建长株潭城际铁路总投资在1500亿元以上，长株潭三市间城际铁路总投资约200亿元。
相同点
都是往返于城际之间的列车，都是不停地开出，都不会挂太多的车厢，都会选择动车组列车，票价都会高于现有普通列车的票价。
